Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP10Q15642 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms