Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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