Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms