Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK3Q15120 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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