Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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RAB39AQ14964 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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RAB39AQ14964 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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RAB39AQ14964 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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