Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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