Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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