Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2H3Q13889 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms