Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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