Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MTMR3Q13615 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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