Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRR1Q13601 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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