Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDE3BQ13370 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms