Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLAMF1Q13291 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms