Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDNQ13061 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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