Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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