Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PTP4A2Q12974 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PTP4A2Q12974 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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