Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms