Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms