Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms