Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSC2Q02487 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms