Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APBA1Q02410 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms