Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms