Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms