Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms