Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSK3BP49841 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms