Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms