Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA4P43694 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA4P43694 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA4P43694 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA4P43694 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms