Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRATP43155 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRATP43155 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRATP43155 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRATP43155 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRATP43155 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRATP43155 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRATP43155 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRATP43155 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRATP43155 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRATP43155 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRATP43155 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRATP43155 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRATP43155 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRATP43155 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRATP43155 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRATP43155 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRATP43155 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRATP43155 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms