Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPHP41219 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPHP41219 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPHP41219 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPHP41219 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPHP41219 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPHP41219 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPHP41219 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPHP41219 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPHP41219 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPHP41219 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPHP41219 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPHP41219 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPHP41219 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPHP41219 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPHP41219 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPHP41219 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPHP41219 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPHP41219 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPHP41219 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPHP41219 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPHP41219 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPHP41219 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPHP41219 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPHP41219 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPHP41219 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPHP41219 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPHP41219 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPHP41219 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPHP41219 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPHP41219 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPHP41219 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms