Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms