Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HTR2AP28223 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms