Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK11BP21127 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms