Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms