Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms