Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms