Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms