Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAMP11215 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms