Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms