Protein–RNA interactions for Protein: P0DM63

NPIPA8, Nuclear pore complex-interacting protein family member A8, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA8P0DM63 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA8P0DM63 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA8P0DM63 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms