Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
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