Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF4AO95239 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF4AO95239 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms