Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX4O95219 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX4O95219 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX4O95219 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms