Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM2O94769 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM2O94769 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM2O94769 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM2O94769 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM2O94769 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM2O94769 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM2O94769 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM2O94769 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM2O94769 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM2O94769 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM2O94769 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM2O94769 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM2O94769 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM2O94769 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ECM2O94769 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM2O94769 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM2O94769 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM2O94769 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms