Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms