Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F6O75461 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F6O75461 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F6O75461 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms