Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF40AO75400 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms