Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA5O60264 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms