Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLIN1O60240 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLIN1O60240 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLIN1O60240 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLIN1O60240 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLIN1O60240 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLIN1O60240 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLIN1O60240 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLIN1O60240 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLIN1O60240 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms