Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAA1O43292 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAA1O43292 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms