Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms